Parejas Yuri

Shizuru x Natsuki
desde un principio Shizuru es la única amiga que tiene Natsuki. Shizuru era una de las representantes de la sala en su segundo año de secundaria. Entonces Natsuki le pregunta a esta si el internet que tienen las representantes de la sala tiene limites como los que tienen los alumnos comunes (si, al parecer el internet para los alumnos en Fuuka era limitado) pero Shizuru le responde que era lo mismo tanto para ella como para los demas. Al ver la cara de desanimo de Natsuki esta se presenta para el cargo de presidenta del consejo estudiantil, ganandole a Haruka porque la presidenta si tiene acceso ilimitado para internet. Es así que Natsuki aprovecha eso sin saber que fue lo que la motivó a Shizuru a postularse.

Luego sucede lo que sucede. Nao ataca a Natsuki, la cual esta tan deprimida que su Child no responde, (si has visto la serie de Mai Hime, ya conoceran la razon por la cual natsuki esta deprimida y pierde sus poderes) y es rescatada por Shizuru que hace su primera aparición como una HiME. De ahí, ella la lleva a la casa de un amigo y le atiende las heridas. Cuando Yukino la encuentra y estas se enfrentan Shizuru confiesa el amor que tiene hacia Natsuki y esta lo escucha a sus espaldas. Shizuru se sorprende de verla y Natsuki claramente la rechaza, causando un estado insano en Shizuru provocando la muerte de los Childs de Nao y Yukino, y la gente del distrito.

En la confrontación final entre ellas, Natsuki acepta el amor que siente por Shizuru y ESA ES LA RAZÓN POR LA QUE SU CHILD REGRESA. Es su única persona importante y por lo tanto recupera las energias. Shizuru ENTIENDE MAL LA EXPLICACIÓN que Natsuki le da justificando el tamaño inmenso de Dhuran y cree que su "omoi" (literalmente "Emoción") que Natsuki siente hacia ella es odio. Es por eso que ella piensa que sus sentimientos son rechazados y la ataca dejando a Natsuki atrapada bajo una campana. Luego la atrae hacia ella y la abraza. Cuando NATSUKI LA BESA Shizuru vuelve en si, y Nastuki ordena a Dhuran que destruya al Child de Shizuru (que también provocaria la destrucción de Dhuran) y ambas desaparecen una en lo brazos de la otra.

Chikane x Himeko:
La historia de Himeko y Chikane, la reencarnación de las sacerdotisas del sol y la luna respectivamente. Ambas son alumnas de secundaria, en la presitigiosa Academia Ototachibana situada en Mahoroba, Japón. Cuando un mal ancestral se alza nuevamente, las chicas son absorbidas por el destino en el instante que el espíritu de las sacerdotisas que llevaban dentro, despierta para defender el mundo contra los Orochi.
Cuando los Orochi despiertan, es el primero de octubre (el mes sin Dios), que casualmente es el día de cumpleaños de Himeko y Chikane. El primer Orochi que intenta matar a las sacerdotisas es S_ma _gami, un joven enamorado de Himeko. Sin embargo, luego de una luz cegadora vuelve en si, rechaza su destino como Orochi, y jura proteger a Himeko de los otros como el hasta las últimas consecuencias. Las sacerdotisas deberán despertar el Ame no Murakumo para salvar el mundo, mientras souma combate los esfuerzos de los Orochi por asesinarlas. Su relacion se vera a lo largo de la serie.

Shizuma x Nagisa
El argumento de la serie posee ciertas similitudes con la serie Maria-sama ga Miteru; ya que relata de un lugar donde existen tres colegios femeninos, y que el poder de los colegios está repartido por un consejo estudiantil.
La historia del anime (y seguramente de la novela y manga) es esta: La acción transcurre en un lugar llamado Astraea Hill, en este lugar hay tres institutos para chicas; la Academia St. Miatre, la Academia St. Spica y finalmente la Academia St. Le Rim. Y después esta la casa de alojamiento común para los tres institutos "Ichigo-Sha".
Nagisa Aoi acaba de ser transferida al cuarto grado (seria el primer año superior o de preparatoria) de la Academia St. Miatre. En su primer día ella conoce a Shizuma Hanazono quien también asiste a St. Miatre y es conocida por el nombre de "Etoile", nombre por el cual se conoce a quien es la líder de todas las estudiantes de las tres escuelas y es muy admirada. Tiene mucho poder y confianza puesta en ella que al mismo tiempo debe cargar con una responsabilidad y deber acorde a tal poder. A traves de la serie nos podemos dar cuenta que existen otras relaciones en la escuela (entre las estudiantes)así como descubrimos algunos oscuros secretos de la misma Etoile los cuales pueden llegar a perjudicar la relación que tiene con Nagisa.

Yumi x Sachiko:
Fukuzawa Yumi que es una estudiante de primer año, ella es una chica comun y corriente (de las ke uno podria decir de las del monton) que un día se detiene para rezar frente a la estatua de la virgen y Sachiko (un miembro del yamayurikai) se le acerca y le arregla el cuello y el lazo que lleva su uniformey en ese monento Tsutako miembro del club de fotografía, les toma una foto, pero para poder publicarla, necesita el permiso de las dos personas mostradas en las fotos, Yumi da el permiso, ahora solo falta Sachiko, Tsutako le pide a Yumi que la acompañe a la “Mansión de las Rosas” donde se reúne el yamayurikai. Cuando Yumi intenta abrir la puerta, Sachiko le cae encima ya que Sachiko iba saliendo. Y así Sachiko le pide a Yumi que sea su petite soeur.
Sachiko no quiere hacer el papel de Cinderella en la obra del festival de primavera, pero para poder abandonar el papel en la obra, necesita tener una "petite soeur" (escogió a Yumi para safarse del papel).
Sin embargo las demás miembros del Yamayurikai no pueden aceptar tal cosa, ya que la escogió al asar (ni si quiera sabia su nombre).Yumi de todas formas no acepta ser la petite soeur (según ella que por su orgullo) Las Grand Soeur le proponen a Sachiko que si puede convencer a Yumi de ser su petite soeur se librara del papel de cinderella. Sachiko tratara de convencer a Yumi de que acepte ser su petite soeur. Bueno se podria decir que desde aki empieza el anime (si acabo de narrar los primeros 2 capitulos) aunque el anime no gira alrededor de esta situación ya que salen mas personajes, que nos mostraran sus relaciones soeur.